技术资料分享
Basic Scientific Research
您当前的位置:首页  > 技术资料分享
非小细胞肺癌免疫逃逸研究:ATF4-LCN2重塑巨噬细胞
探索生命空间,助力基础研究

PREFACE 00

前言

非小细胞肺癌细胞长期处于缺氧、营养竞争、氧化应激、内质网应激和治疗压力之中。为了维持生存,肿瘤细胞会启动整合应激反应,其中ATF4是最重要的转录调控节点之一。

过去研究ATF4,重点通常放在肿瘤细胞自身。ATF4可以帮助癌细胞调整氨基酸代谢、氧化还原平衡、蛋白稳态和线粒体功能,使细胞在低营养和治疗压力下继续存活。

新的研究把ATF4的作用进一步推进到了肿瘤免疫层面。

在肺腺癌模型中,ATF4缺失以后,肿瘤生长在免疫完整宿主中受到明显抑制,但在免疫缺陷小鼠中这一差异大幅减弱。这提示ATF4带来的生长优势并不完全来自癌细胞自身增殖,其中相当一部分依赖宿主免疫系统。

继续向下追踪发现,ATF4能够直接促进脂质运载蛋白2,也就是LCN2的表达。LCN2由肿瘤细胞释放以后,并不是主要作用于癌细胞本身,而是通过巨噬细胞表面的SLC22A17改变间质巨噬细胞状态,使CXCL9降低、IL-6等免疫抑制相关信号增强,最终减少CD4⁺和CD8⁺T细胞进入肿瘤内部。

于是,原本发生在肿瘤细胞内部的应激反应,被转换成了一个细胞外免疫信号:

细胞应激激活ATF4,ATF4增加LCN2分泌,LCN2重编程巨噬细胞,巨噬细胞进一步限制T细胞进入肿瘤。

这条机制真正值得研究的地方,是它把“癌细胞怎么适应恶劣环境”和“肿瘤为什么形成免疫排斥”两个过去经常分开的方向连接了起来。

导读

一、ATF4研究为什么需要从细胞内应激走向免疫生态位

二、LCN2如何成为ATF4的关键胞外效应物

三、LCN2为什么主要重塑间质巨噬细胞

四、巨噬细胞如何进一步造成T细胞排斥

五、ATF4-LCN2轴如何连接应激与免疫治疗耐受

六、这一方向应该怎样搭建细胞和动物模型

七、如何建立ATF4-LCN2-巨噬细胞的因果闭环

八、检测指标怎样覆盖肿瘤细胞、髓系细胞和T细胞

九、已有机制之后还能往哪些问题继续深入

十、这一方向最容易出现哪些实验设计偏差

SECTION 01

01

ATF4研究为什么需要从细胞内应激走向免疫生态位

1、ATF4过去主要被当成癌细胞的应激适应因子

整合应激反应可以由多种压力启动。

氨基酸缺乏、内质网应激、氧化压力和治疗损伤等条件最终都可以使eIF2α相关翻译调控发生改变,并促进ATF4蛋白积累。

ATF4随后启动氨基酸代谢、抗氧化、蛋白稳态和应激存活相关程序。

因此,一个非常常见的实验逻辑是:

肿瘤细胞受到压力→ATF4升高→癌细胞存活增加→肿瘤生长加快。

这条逻辑没有错,但无法解释ATF4缺失为什么在免疫完整和免疫缺陷宿主中产生明显不同的肿瘤表型。

如果ATF4的作用主要来自癌细胞内部,那么换一个缺少适应性免疫系统的宿主,理论上不应该让ATF4缺失的效应发生如此明显变化。

这种宿主依赖性本身就是一个很重要的机制线索。

2、免疫完整与免疫缺陷模型的差异提示细胞外机制

原始研究使用KRAS/TP53相关肺腺癌细胞发现,ATF4缺失以后,在免疫完整小鼠中的肿瘤进展明显减慢;而进入免疫缺陷宿主以后,ATF4缺失造成的生长抑制明显减弱。

进一步耗竭CD4⁺或CD8⁺T细胞后,ATF4缺失肿瘤原有的生长抑制也可以被逆转。

这说明ATF4的作用不能只从癌细胞增殖和死亡解释。

ATF4还在决定肿瘤是否允许T细胞建立有效抗肿瘤反应。

从实验设计角度看,这一点非常值得借鉴。

研究一个肿瘤细胞内分子时,如果在免疫完整和免疫缺陷动物中得到完全不同的结果,就应该主动考虑细胞外效应,而不是继续把所有机制集中在癌细胞内部。

SECTION 02

02

LCN2如何成为ATF4的关键胞外效应物

1、ATF4需要一个能够把细胞内应激传递出去的分子

ATF4本身是转录因子,位于癌细胞内部。

如果它要影响巨噬细胞和T细胞,就必须通过分泌蛋白、代谢物或者其他细胞间通讯介质完成信号传递。

针对ATF4调控基因进行体内功能筛选以后,LCN2成为其中非常关键的候选分子。

LCN2是一种可分泌蛋白,过去更多因铁结合、细菌铁载体以及炎症调节受到关注。新的肺癌研究显示,它还可以承担肿瘤细胞和髓系细胞之间的信号传递。

ATF4缺失以后LCN2明显下降;Lcn2缺失又能够在免疫完整宿主中复制ATF4缺失的部分表型。

这使LCN2从“ATF4相关基因”进一步成为具有功能性的下游效应物。

2、ATF4可以直接调控LCN2转录

LCN2并不是只有炎症时才会升高。

经典上,NF-κB能够调节LCN2表达,但肿瘤细胞的应激反应也能够独立提高LCN2。

例如谷氨酰胺缺乏和内质网应激均可以增加ATF4和LCN2,而抑制整合应激反应后,LCN2的这种应激性升高受到明显抑制。

进一步的染色质结合实验还提示ATF4可以直接占据LCN2调控区域。

因此,LCN2至少存在两类重要输入:

一类来自炎症相关NF-κB;

另一类来自细胞应激相关ATF4。

这一点对于后续实验非常重要。

如果在低营养或缺氧条件下观察到LCN2升高,不能直接全部归因于炎症;如果IL-1β刺激同样使LCN2增加,也不能把所有LCN2都解释成ATF4作用。

后续研究最好把两条输入拆开。

3、ATF4和炎症可能共同放大LCN2

肿瘤微环境中,应激和炎症通常不会单独存在。

癌细胞可能同时处于谷氨酰胺不足、低氧和炎症细胞因子刺激环境。

这意味着ATF4和NF-κB可能共同决定LCN2最终达到多高水平。

从机制上看,这提供了一个很有价值的问题:

LCN2是否就是肿瘤细胞把“代谢压力”和“炎症压力”整合成统一免疫逃逸输出的节点?

如果成立,LCN2就不再只是ATF4的一个下游分子,而更像多种微环境压力汇聚后的信号出口。

SECTION 03

03

LCN2为什么主要重塑间质巨噬细胞

1、肺癌中的巨噬细胞不能作为一个整体研究

肺组织本身就存在肺泡巨噬细胞,同时肿瘤形成以后还会出现多类间质巨噬细胞和单核细胞来源巨噬细胞。

不同群体的位置和功能差异很大。

LCN2受到抑制以后,最明显的变化之一并不是所有巨噬细胞同步减少,而是间质巨噬细胞组成发生重新分配。

SPP1相关、CX3CR1相关的间质巨噬细胞减少,而肺泡巨噬细胞比例相对增加。

这提示LCN2作用具有明显的细胞状态和生态位选择性。

因此,这一方向不适合继续用“肿瘤相关巨噬细胞增加或减少”作为主要结论。

更值得研究的是哪类巨噬细胞真正响应LCN2。

2、SLC22A17把LCN2信号定位到了巨噬细胞

LCN2作为可溶性蛋白,需要通过受体影响靶细胞。

SLC22A17是已知LCN2受体之一。

在肺癌免疫微环境中,SLC22A17的表达主要集中在巨噬细胞,而其他免疫群体中表达相对有限,这为LCN2优先作用于巨噬细胞提供了细胞基础。

进一步敲低巨噬细胞SLC22A17以后,LCN2诱导的CXCL9下降和IL-6升高明显受到削弱。

因此可以建立一条较清晰的信号关系:

肿瘤细胞分泌LCN2→巨噬细胞SLC22A17识别→巨噬细胞功能状态改变。

这里真正值得继续向下做的,是SLC22A17之后发生了什么。

3、LCN2改变的是巨噬细胞功能状态,而不只是数量

LCN2处理巨噬细胞后,一个非常关键的变化是CXCL9降低,同时IL-6增加。

CXCL9具有募集效应T细胞进入肿瘤的重要作用,而IL-6在多种肿瘤环境中与免疫抑制和慢性炎症相关。

因此,LCN2创造的并不是简单“更多巨噬细胞”。

它更像是在把间质巨噬细胞推入一种不利于T细胞进入的状态。

变化层级LCN2高时的主要特征可能结果
巨噬细胞组成SPP1、CX3CR1相关间质巨噬细胞增加促免疫逃逸髓系生态位扩大
趋化因子CXCL9下降T细胞进入肿瘤减少
炎症信号IL-6增加维持免疫抑制性炎症
T细胞CD4⁺、CD8⁺浸润下降形成免疫排斥
肿瘤结果免疫监视减弱肿瘤持续生长

因此,研究LCN2时,巨噬细胞数量和巨噬细胞功能必须同时看。

SECTION 04

04

巨噬细胞如何进一步造成T细胞排斥

1、CXCL9是连接巨噬细胞和T细胞的重要节点

肿瘤内部有没有CD8⁺T细胞,不能只由外周T细胞数量决定。

真正有效的T细胞需要经过趋化、进入肿瘤组织,再与肿瘤细胞建立接触。

巨噬细胞来源CXCL9是这一过程中的重要趋化信号。

当LCN2降低以后,间质巨噬细胞CXCL9增加,肿瘤内部CD8⁺T细胞随之增加。

三维胶原共培养实验进一步显示,LCN2缺失条件下T细胞更容易进入肿瘤细胞—巨噬细胞体系;当CXCL9被中和后,这种T细胞进入优势明显减弱。

这就把:

LCN2下降;

巨噬细胞CXCL9恢复;

T细胞进入增加

三件事连接成了功能链。

2、研究T细胞排斥不能只计算CD8数量

如果研究目标是“免疫排斥”,单纯计算整块肿瘤中的CD8⁺细胞比例并不够。

需要进一步区分T细胞在哪里。

一个肿瘤可以有不少CD8⁺T细胞,但这些细胞全部停留在肿瘤边缘或基质区域,仍然属于典型免疫排斥。

因此建议至少区分:

肿瘤实质CD8⁺T细胞;

基质CD8⁺T细胞;

肿瘤边缘CD8⁺T细胞;

T细胞到肿瘤细胞的空间距离。

这样才能真正判断ATF4-LCN2轴是否改变T细胞“进入肿瘤”的能力。

3、T细胞进入以后还要看功能

T细胞数量增加只是第一步。

后续最好增加:

IFN-γ;

Granzyme B;

CD107a;

Ki67;

必要的耗竭相关标志。

如果LCN2抑制后既增加T细胞进入,又提高细胞毒功能,说明这个轴影响的不只是空间排斥,还可能进一步改变T细胞效应状态。

SECTION 05

05

ATF4-LCN2轴如何连接应激与免疫治疗耐受

1、免疫排斥本身就是免疫检查点治疗失效的重要原因

PD-1/PD-L1抑制剂需要肿瘤内已经存在能够被重新激活的T细胞。

如果T细胞根本进不去肿瘤,仅仅解除PD-1抑制往往很难产生充分疗效。

ATF4-LCN2轴提供的正是这样一种机制:

癌细胞受到持续应激以后增加LCN2,LCN2通过巨噬细胞降低CXCL9,最终把T细胞挡在肿瘤外。

因此,这条轴更接近“免疫排斥型耐受”,而不只是传统意义上的T细胞耗竭。

2、LCN2降低可以把冷肿瘤向可浸润状态推动

在原始肺腺癌模型中,单独PD-1治疗效果有限。

LCN2被中和后,CD4⁺和CD8⁺T细胞进入肿瘤增加;进一步联合PD-1阻断以后,生存获益继续提高。

对于基础科研而言,重点并不在于马上把LCN2当成新的治疗靶点。

更值得研究的是:

一个原本T细胞进不去的肿瘤,能否通过改变髓系生态位先变成“可进入”,随后才获得免疫检查点治疗敏感性?

这是一种与传统“恢复耗竭T细胞功能”不同的免疫治疗增敏逻辑。

SECTION 06

06

这一方向应该怎样搭建细胞和动物模型

1、肿瘤细胞层先证明ATF4控制LCN2

可以使用KRAS驱动肺腺癌细胞、NSCLC细胞系或相应类器官。

设置基础培养以及谷氨酰胺缺乏、内质网应激等条件,观察:

ATF4;

LCN2;

典型ATF4靶基因;

细胞存活。

随后进行ATF4敲低、敲除或恢复。

如果ATF4降低后LCN2无法被应激诱导,并通过ATF4恢复重新建立,就能完成第一层验证。

2、巨噬细胞层重点证明LCN2-SLC22A17

使用骨髓来源巨噬细胞或肺来源巨噬细胞。

分别给予:

肿瘤细胞条件培养基;

ATF4缺失肿瘤条件培养基;

LCN2缺失条件培养基;

重组LCN2;

SLC22A17干预。

重点检测CXCL9、IL-6和巨噬细胞状态。

这样可以把肿瘤细胞ATF4与巨噬细胞功能直接连接起来。

3、三维体系用于验证T细胞进入

可以在三维胶原中同时加入:

肺癌细胞;

巨噬细胞;

CD8⁺T细胞。

比较ATF4或LCN2不同状态下T细胞进入肿瘤细胞区域的距离和数量。

再加入CXCL9中和。

这一层最大的价值是把“巨噬细胞因子变化”真正变成可观察的T细胞空间迁移。

4、动物实验必须使用免疫完整模型

如果课题核心是巨噬细胞和T细胞免疫逃逸,裸鼠或NSG异种移植不能作为主要验证模型。

优先使用免疫完整同系肺癌模型。

原位肺内模型相比皮下模型更有价值,因为肺泡巨噬细胞、间质巨噬细胞以及肺组织特异微环境都能够被保留。

如果条件允许,再增加遗传性KRAS相关肺腺癌模型,会更有利于验证肿瘤自然发生过程中的ATF4-LCN2作用。

SECTION 07

07

如何建立ATF4-LCN2-巨噬细胞的因果闭环

这个方向最容易出现的问题,是ATF4、LCN2、巨噬细胞和T细胞全部发生变化,却没有明确上下游。

建议至少完成四层验证。

1、证明ATF4对LCN2的必要性

ATF4缺失后LCN2下降。

随后重新表达LCN2。

如果LCN2恢复以后,即使ATF4仍然缺失,巨噬细胞免疫抑制和T细胞排斥能够部分恢复,就说明LCN2确实承担ATF4的细胞外效应。

2、证明LCN2主要通过巨噬细胞发挥作用

直接处理巨噬细胞,并阻断SLC22A17。

如果LCN2已经存在,但巨噬细胞无法通过SLC22A17响应,CXCL9下降和IL-6升高应明显削弱。

这一层可以把LCN2作用从泛泛的“改变免疫微环境”定位到具体受体和细胞。

3、证明CXCL9参与T细胞排斥

在LCN2缺失条件下,巨噬细胞CXCL9恢复、T细胞进入增加。

随后中和CXCL9。

如果T细胞进入重新减少,就能证明CXCL9不是伴随指标,而是真正的功能节点。

4、证明最终肿瘤表型依赖T细胞

ATF4或LCN2缺失后肿瘤受抑,再进行CD4⁺或CD8⁺T细胞耗竭。

如果肿瘤重新恢复生长,才能证明这条机制最终依靠适应性免疫产生抗肿瘤效应。

最终可以形成一条较完整的因果链:

肿瘤应激→ATF4→LCN2→巨噬细胞SLC22A17→CXCL9下降→T细胞排斥→免疫逃逸。

SECTION 08

08

检测指标怎样覆盖肿瘤细胞、髓系细胞和T细胞

这一方向指标很多,但最好按照三个细胞层级组织。

层级推荐指标主要回答的问题
肿瘤应激p-eIF2α、ATF4及代表性ATF4靶基因整合应激反应是否激活
肿瘤输出LCN2表达、分泌水平应激是否形成胞外信号
巨噬细胞受体SLC22A17哪类细胞能够响应LCN2
巨噬细胞状态CXCL9、IL-6、SPP1、CX3CR1及空间位置是否进入免疫抑制状态
T细胞浸润CD4、CD8及肿瘤内/基质分布是否形成T细胞排斥
T细胞功能IFN-γ、Granzyme B、CD107a进入肿瘤后的T细胞是否有效
最终功能肿瘤负荷、生存及免疫治疗反应机制是否具有疾病意义

这里尤其不建议重新回到M1/M2框架。

LCN2研究最重要的是间质巨噬细胞状态、CXCL9/IL-6功能和空间分布,而不是简单比较CD86与CD206。

SECTION 09

09

已有机制之后还能往哪些问题继续深入

ATF4-LCN2-巨噬细胞-T细胞排斥这条主线已经比较完整。如果后续只是重新验证“ATF4高、LCN2高、CD8低”,创新空间有限。

更值得继续推进的是几个尚未解决的问题。

1、什么压力最容易在肺癌中启动ATF4-LCN2

真实肿瘤中ATF4可能由多种因素共同激活。

低氧、谷氨酰胺竞争、内质网应激、氧化应激和药物治疗都可能参与。

可以在相同肿瘤细胞中分别模拟这些压力,比较ATF4和LCN2动力学。

如果某一种压力特别容易形成高LCN2状态,再进一步在动物中验证,就能够把免疫逃逸连接到具体肿瘤生态位。

2、LCN2如何通过SLC22A17改变巨噬细胞转录状态

这是目前非常值得做的机制缺口。

已经知道LCN2能够结合SLC22A17,也知道CXCL9和IL-6随之变化,但受体之后的胞内信号仍然没有完全拆清楚。

下一步可以围绕SLC22A17内吞、胞内信号以及CXCL9调控机制进行研究。

如果能够解释一个膜受体如何最终关闭T细胞趋化因子,这条轴会从细胞互作推进到完整分子机制。

3、LCN2是在招募巨噬细胞,还是重编程已经存在的巨噬细胞

目前可以同时看到间质巨噬细胞数量和状态变化。

但这两个过程需要拆开。

可以通过短期诱导性LCN2敲低,先观察已经存在的巨噬细胞是否迅速恢复CXCL9,再观察更长时间后巨噬细胞数量是否改变。

如果功能先变、数量后变,说明LCN2首先完成状态重编程。

如果巨噬细胞募集首先改变,则需要进一步研究趋化和来源。

4、为什么LCN2形成局部免疫排斥

LCN2本身是可溶性蛋白,理论上可以扩散。

但人肺腺癌组织中可以看到LCN2高表达区域与T细胞低浸润区域形成明显局部对应。

这提示LCN2作用可能具有空间限制。

一种可能是LCN2与局部ECM结合;另一种可能是分泌后很快被附近SLC22A17阳性巨噬细胞捕获。

如果把这一点做清楚,可以解释为什么同一肿瘤内部会同时出现免疫炎症区和免疫排斥区。

5、ATF4-LCN2是否属于治疗诱导的免疫逃逸

放疗、化疗和靶向治疗都可能给残留细胞带来强烈应激。

因此可以设计治疗前后时间序列,观察ATF4和LCN2是否在残留细胞中增加,随后间质巨噬细胞和T细胞空间结构是否改变。

如果成立,就会出现一个更有临床意义的机制:

治疗杀死大部分癌细胞,但残留细胞通过应激反应启动LCN2,重新建立免疫排斥生态位。

这比单纯研究未经治疗肿瘤中的ATF4更值得继续向前推进。

6、不同非小细胞肺癌亚型是否共享这一机制

目前最完整的功能证据来自KRAS/TP53相关肺腺癌模型,临床关联也在肺腺癌中比较突出。

因此,标题可以讨论非小细胞肺癌,但实验结论不能直接默认肺鳞癌、EGFR突变肺腺癌、ALK融合肿瘤全部使用相同机制。

后续很值得比较:

KRAS驱动肺腺癌;

EGFR驱动肺腺癌;

肺鳞癌。

如果ATF4-LCN2在某些遗传背景中特别强,反而能够进一步解释不同NSCLC免疫生态位和免疫治疗敏感性的差异。

SECTION 10

10

这一方向最容易出现哪些实验设计偏差

第一个问题,是看到ATF4敲低后肿瘤变小,就全部解释为癌细胞增殖下降。必须通过免疫完整和免疫缺陷宿主比较,判断免疫贡献。

第二个问题,是LCN2升高以后直接认为来自ATF4。NF-κB同样可以强烈调节LCN2,最好通过ATF4干预和应激条件建立直接关系。

第三个问题,是只检测肿瘤组织LCN2总量。需要确认LCN2主要来自癌细胞还是宿主髓系细胞,因为两者生物学意义可能不同。

第四个问题,是把所有巨噬细胞合并分析。LCN2对间质巨噬细胞尤其重要,肺泡巨噬细胞和不同间质亚群应该尽量区分。

第五个问题,是继续使用M1/M2作为主要机制。CXCL9、IL-6、SPP1、CX3CR1以及真实T细胞募集功能更有信息量。

第六个问题,是看到CD8⁺T细胞增加就认为免疫排斥解除。需要区分肿瘤内部、基质和肿瘤边缘的空间位置。

第七个问题,是SLC22A17表达以后就直接确认它是功能受体。需要通过敲低或阻断证明LCN2效应依赖SLC22A17。

第八个问题,是CXCL9下降以后就直接解释T细胞排斥。中和和救援实验能够明显提高因果证据。

第九个问题,是用裸鼠异种移植研究整条免疫逃逸机制。缺少完整T细胞和宿主免疫时,很难回答ATF4-LCN2的核心问题。

第十个问题,是把肺腺癌模型结果直接推广到全部非小细胞肺癌。后续最好进行遗传背景和组织学亚型验证。

非小细胞肺癌中的整合应激反应过去更多被理解为一种“癌细胞求生程序”。

ATF4帮助细胞在低营养、内质网压力和治疗损伤下维持代谢与存活,因此研究重点长期集中在肿瘤细胞自身。

LCN2机制增加了一个新的层次。

癌细胞启动ATF4以后,并没有把全部应激适应留在自己体内。ATF4还会促进LCN2分泌,把肿瘤细胞内部的压力状态向外传递给巨噬细胞。LCN2通过SLC22A17使间质巨噬细胞进入CXCL9低、免疫抑制性增强的状态,最终限制CD4⁺和CD8⁺T细胞进入肿瘤。

因此,一个癌细胞能否适应压力,不再只是决定它自己能不能活。

它还可以决定周围免疫系统能不能靠近它。

后续围绕这一方向立题,我更建议优先做两个接口:一是明确肺癌中究竟哪一种应激最容易触发ATF4-LCN2免疫逃逸;二是继续向下拆解SLC22A17如何改变巨噬细胞CXCL9和IL-6程序。

如果再加入治疗后残留场景,就可以进一步回答一个更有价值的问题:抗肿瘤治疗是否在杀伤大部分癌细胞的同时,迫使剩余细胞进入高ATF4状态,并通过LCN2重新制造一个T细胞难以进入的保护性生态位。

把这一过程做清楚,整合应激反应研究就能从“癌细胞如何耐受压力”,继续推进到“癌细胞如何利用压力重构整个抗肿瘤免疫环境”。

联系我们
Contact us
地址:南京市雨花台区长虹路445号6号楼
电话:86-025-52169496
传真:86-025-52169496
业务咨询专线:17302579479
邮编:210000
邮箱:biornservice@163.com
微信扫码关注
我们的公众号
文字内容为主
小红书APP扫码关注
我们的小红书官方号
短视频博客形式为主
医药企业入口:
全球新药动态、相关政策解读、临床前研究综合解决方案、 临床前研究路径与方案选择指南分享
如您是高校/医院科研人员,请切换至基础科研工作者界面
E-mail
biornservice@163.com
Tel
86-025-52169496
17302579479
微信扫描二维码
快捷添加售前技术
返回顶部
Contact us