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RNA pull-down 实验服务
探索生命空间,助力基础研究

南京博恩生物技术有限公司面向高校、科研院所、医药企业与生物技术企业,提供从方案评估、RNA 诱饵设计与标记、样本裂解、pull-down 富集、蛋白检测到结果分析的一站式 RNA pull-down 实验外包服务。服务覆盖 lncRNA 结合蛋白筛选、circRNA 结合蛋白验证、mRNA/UTR 结合蛋白研究、RNA 片段结合区域分析、RNA 突变体功能验证、药物处理前后 RNA-蛋白互作变化比较及发表级数据整理。

RNA pull-down 是一种以标记 RNA 作为“诱饵”富集 RNA 结合蛋白(RBP)的实验技术。

交付包含原始条带图、输入对照、pull-down 结果图、必要时的突变体/截短体比较图、统计分析图及完整中文报告。
项目完成后提供终身售后支持,针对结果解释、图版整理、投稿补充材料准备及后续问题持续响应。


服务适用场景

本服务适用于 lncRNA/circRNA 结合蛋白筛选与验证、RNA 片段与蛋白直接结合分析、UTR 区域与 RNA 结合蛋白互作研究、mRNA 稳定性调控机制研究、miRNA 前体或功能区相关蛋白研究、RNA 突变位点功能验证、RNA 截短体结合区域定位,以及药物处理前后 RNA-蛋白互作变化比较。

适用客户类型

  • 高校与科研院所:lncRNA / circRNA 机制研究、RNA 调控网络研究、论文机制数据补充

  • 医药企业:RNA 靶点作用机制验证、药物影响 RNA-蛋白互作研究

  • 生物技术企业:RNA 结合蛋白功能验证、RNA 调控产品开发支持

适用研究方向

  • lncRNA / circRNA 结合蛋白研究

  • RNA 片段与结构域互作分析

  • mRNA 稳定性与翻译调控研究

  • UTR 区域结合蛋白研究

  • RNA 突变体与截短体功能验证

  • 药物干预前后 RNA-蛋白互作变化分析


RNA pull-down 常见认识误区

RNA pull-down 检测的是 “某条 RNA 能拉下哪些蛋白”,它是从 RNA 角度 出发研究 RNA-蛋白互作;而 RIP 则是从 蛋白角度 出发,检测某个 RNA 结合蛋白结合了哪些 RNA。

另一个常见误区,是把 RNA pull-down 结果直接等同于“体内真实互作已经被完全证明”。实际上,RNA pull-down 更偏 体外或半体外富集验证,非常适合筛选和验证候选结合蛋白,但如果要进一步证明细胞内真实复合物存在,通常还建议结合 RIP、CLIP 或功能实验。


服务流程

客户发送方案 → 方案评估 → 问题反馈与优化 → 正式报价 → 签订合同 → 支付预付款 → 开始实验 → 提交 PDF 版结果报告 → 支付尾款 → 提交完整报告。

流程说明

1. 客户发送方案
提交研究目的、目标 RNA、候选结合蛋白、RNA 序列信息、物种、样本类型、处理条件及参考文献。

2. 方案评估
评估实验是否适合 RNA pull-down,确认是做全长 RNA、片段 RNA、突变体 RNA,还是截短体比较;并确认下游检测采用 Western blot、银染预判或质谱筛选。

3. 问题反馈与优化
指出方案中可能存在的问题,如 RNA 片段设计不合理、突变位点不够聚焦、目标问题更适合 RIP、RNA 结构过长导致体外转录困难、下游候选蛋白缺少可用抗体等,并进行优化。

4. 正式报价
根据样本数量、RNA 诱饵数量、是否需 WT/Mut、是否需截短体、是否需质谱筛选、是否需重复实验和发表级图版整理等出具正式报价。

5. 签订合同并支付预付款
确认合作内容、周期及交付标准。

6. 开始实验
进入 RNA 体外转录/合成、标记、与裂解液孵育、磁珠富集、洗涤、洗脱、蛋白检测和数据分析流程。

7. 提交 PDF 版结果报告
实验完成后先提交 PDF 版结果报告供客户确认。

8. 支付尾款并提交完整报告
尾款支付完成后,提交完整终版报告、原始条带图、pull-down 结果图、统计图及整理版发表素材。


样本与 RNA 诱饵要求

RNA pull-down 的核心在于 RNA 诱饵质量、标记效率、裂解液背景控制和下游检测策略

样本要求

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设计说明

  • 全长 RNA 更适合做初筛

  • 片段 RNA / 截短体 更适合做结合区域定位

  • 突变体 RNA 更适合验证某个      motif 或结构位点是否必要

  • 未知结合蛋白常先做筛选,再结合 RIP 或功能实验继续验证。


交付内容

交付内容包含中文版实验报告、RNA 诱饵信息、样本信息、实验方法、pull-down 条件说明、输入对照说明、原始条带图、pull-down 结果图、WT/Mut 或截短体比较图、统计分析图、图注、结果描述、结论总结及完整终版报告。

标准交付清单

  • 中文版实验报告

  • RNA 诱饵与样本信息

  • 实验方法学描述

  • 输入对照图

  • 原始条带图

  • pull-down 结果图

  • WT/Mut 或截短体比较图

  • 统计分析图

  • 图注与结果说明

  • 发表级图版整理

  • 完整终版报告

售后支持

项目完成后提供终身售后支持,包括:

  • 结果解释

  • RNA 设计说明

  • 图版整理

  • 投稿补充材料支持

  • 后续答疑与补充说明


周期与报价方式

常规 RNA pull-down 项目周期通常为30–45 个工作日。涉及全长 RNA 体外转录、多个片段或突变体比较、未知蛋白筛选、质谱联用、重复实验或发表级图版整理的项目周期相应延长。与 RIP 相比,RNA pull-down 的核心难点更多集中在 RNA bait 的设计与制备,以及背景控制和下游蛋白识别策略。

报价因素

  • RNA 诱饵数量

  • 是否需全长 / 片段 / 突变体 / 截短体设计

  • 样本数量

  • 是否需未知蛋白筛选或质谱

  • 是否需重复实验

  • 是否需统计分析与发表级图版整理


常见问题

RNA pull-down 主要检测什么?
主要检测某条 RNA 是否能富集特定蛋白,或者能拉下哪些 RNA 结合蛋白。

RNA pull-down 和 RIP 的区别是什么?
RNA pull-down
是从 RNA 角度找蛋白;RIP 是从 蛋白角度找 RNA。二者经常联合使用:前者筛候选蛋白,后者验证细胞内相关 RNA 是否真正与该蛋白结合。

RNA pull-down 可以做 RNA 片段和突变体分析吗?
可以,而且这是高频应用。通过比较全长、截短体和突变体 RNA 的拉下能力,常可初步定位蛋白结合区域或关键结构位点。

pull-down 后下游能做什么?
已知候选蛋白通常用 Western blot 检测;未知蛋白可进一步送质谱分析。

结果是否可直接用于发表?
交付包含原始条带图、输入对照、pull-down 结果图、统计图、图注说明及整理版图版,可直接用于论文、汇报和结题材料整理。


RNA pull-down 原理

RNA pull-down 的核心原理是将带标记的 RNA 作为诱饵,与细胞或组织裂解液孵育,使结合该 RNA 的蛋白被共同捕获;随后借助链霉亲和素磁珠等体系富集 RNA-蛋白复合物,并通过 Western blot 或质谱分析结合蛋白。


RNA pull-down 实验步骤

1. RNA 诱饵设计

根据研究目的确定使用全长 RNA、片段 RNA、突变体 RNA 或截短体 RNA。
全长更适合筛选,片段和突变体更适合定位结合区域。

2. RNA 合成与标记

通过体外转录或化学合成获得目标 RNA,并进行末端标记。

3. 裂解液准备

制备尽量温和、背景受控的细胞或组织裂解液,保留潜在 RNA-蛋白结合能力。

4. 结合反应

将标记 RNA 与裂解液孵育,使可结合蛋白形成 RNA-蛋白复合物。

5. 磁珠富集

利用 streptavidin magnetic beads 富集带标签 RNA 及其结合蛋白。

6. 洗涤

去除非特异性背景,尽量保留特异性结合蛋白。

7. 洗脱与检测

洗脱复合物后,已知蛋白可做 Western blot;未知蛋白可做质谱筛选。

8. 数据分析

比较不同 RNA 诱饵、不同处理组、不同突变体/截短体的拉下结果,判断哪些蛋白结合、结合是否特异、哪一段 RNA 更关键。


RNA pull-down 常见应用场景

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RNA pull-down 与相关实验的应用区别

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技术选择逻辑

  • 研究 某 RNA 能拉下哪些蛋白:优先 RNA pull-down

  • 研究 某 RNA 结合蛋白结合了哪些 RNA:优先      RIP

  • 研究 某蛋白是否结合 DNA:优先 ChIP

  • 研究 两个蛋白是否形成复合物:优先 Co-IP

  • 研究 RNA / DNA 在组织中位于哪里:优先 原位杂交


RNA 诱饵设计与分析策略

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南京博恩生物技术有限公司提供面向科研客户与医药企业的 RNA pull-down 实验外包服务,覆盖 RNA 结合蛋白筛选、lncRNA/circRNA 互作验证、RNA 片段与突变体功能分析及发表级数据整理。项目交付包含原始条带图、输入对照、pull-down 结果图、统计分析图及完整中文报告,并提供终身售后支持。
客户提交方案后,项目按“方案评估—问题反馈—报价签约—实验执行—PDF 结果确认—完整报告交付”的标准流程推进。交付结果可直接用于课题研究、论文整理、项目申报与结题汇报。







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