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circRNA 研究综合解决方案
探索生命空间,助力基础研究

表达筛选 + 回环验证 + 定位分析 + 功能验证 + 机制解析一体化服务,帮助客户系统建立 circRNA 研究证据链

南京博恩生物技术有限公司面向高校、科研院所、医药企业与生物技术企业,提供覆盖 circRNA 表达筛选、回环结构验证、亚细胞定位、功能表型验证、circRNA-miRNA-mRNA 轴分析、RNA-蛋白互作、翻译潜能研究、转录与表观调控解析 的系统化研究服务。
我们将 circRNA 研究从“做一个差异表达验证”升级为“围绕具体机制问题构建完整研究路线”,帮助客户围绕肿瘤、炎症、纤维化、代谢疾病、神经退行性疾病和免疫相关疾病建立更清晰、更可靠、更适合发表的研究方案。circRNA 研究的主流综述普遍认为,其核心不只是“是否差异表达”,而是 回环是否真实存在、定位在哪里、与谁互作、通过什么层面发挥功能。


circRNA(circular RNA)是由前体 mRNA 通过反向剪接形成的共价闭环 RNA 分子,通常没有 5' cap 和 3' poly(A) tail,因此相较线性 RNA 更耐受外切核酸酶降解,通常具有更高稳定性。当前综述普遍认为,circRNA 的研究重点主要围绕三大问题展开:它是如何形成的、它如何发挥功能、它如何被可靠验证。

目前较常见的 circRNA 机制框架主要包括:

  • miRNA 海绵 / ceRNA 机制

  • RNA 结合蛋白(RBP)互作调控

  • 蛋白支架、蛋白诱饵、蛋白募集

  • 转录与剪接调控

  • 翻译模板功能

  • 核内调控与输出转运相关功能

  • 作为生物标志物和潜在治疗分子

与 lncRNA 相比,circRNA 研究有两个非常突出的特点:
第一,必须优先证明该分子确实是闭环 RNA,而不是线性转录本或转录伪影;
第二,circRNA 机制常高度依赖其回环位点、定位和稳定性优势。近年的技术与方法学综述都强调,circRNA 研究不能只做 qPCR,而应结合 反向引物、RNase R 处理、回环位点测序、定位分析和功能 rescue 共同建立证据链。

南京博恩生物技术有限公司围绕这些真实研究问题,提供从 候选筛选、回环验证、定位判断、功能验证、机制分类、互作解析到因果验证 的完整支持,帮助客户把“一个差异表达的 circRNA”升级为“一个有清晰机制和功能定位的研究对象”。


服务范围

1. circRNA 表达筛选与候选发现服务

包括 差异表达筛选、数据库辅助分析、RNA-seq 结果解读、候选 circRNA 优选、样本间表达比较与 qPCR 验证。

2. circRNA 回环结构验证服务

包括 反向引物 qRT-PCR、RNase R 处理验证、Sanger 测序验证 back-splice junction、线性/环状对照验证。
这是 circRNA 研究中最基础也最关键的一步。

3. circRNA 定位与基础属性研究服务

包括 核/胞质分离、RNA FISH、原位杂交、亚细胞定位成像、核输出相关分析。
定位是判断 circRNA 机制方向的重要前提。多数 circRNA 在细胞质中更丰富,但核内 circRNA 往往与转录、剪接和宿主基因表达调控关系更紧密。

4. circRNA 功能验证服务

包括 过表达、敲低/敲除、表型实验、药效配套验证、细胞行为与疾病模型验证。
该阶段主要回答“这个 circRNA 是否真的影响增殖、迁移、侵袭、凋亡、炎症、纤维化、代谢或免疫行为”。由于 circRNA 与宿主线性转录本 often 共线,功能实验设计通常需要特别注意环状与线性转录本的区分。

5. circRNA 机制解析服务

包括 circRNA-miRNA 结合验证、双荧光素酶、Ago2-RIP、RNA pull-down、RIP、蛋白互作验证、翻译潜能分析、宿主基因转录/剪接联动分析。
当前主流综述认为,circRNA 机制研究最常见的三大主线是 miRNA 海绵、RBP 调控和翻译潜能,同时也包括对宿主基因转录与剪接的反馈调控。

6. circRNA 疾病应用研究服务

包括 肿瘤、炎症、呼吸系统疾病、代谢疾病、神经系统疾病及标志物/治疗转化研究。
近年综述已将 circRNA 明确纳入癌症、心代谢疾病、神经退行性疾病等方向的重要研究对象,并强调其作为稳定标志物和潜在治疗载体/靶点的价值。


服务优势

1. 不把 circRNA 研究简单等同于“表达差异”

circRNA 研究最常见的问题,不是“找不到差异”,而是“没有证明它真的是 circRNA,也没有证明它通过什么方式起作用”。当前方法学文献一致强调,circRNA 研究必须优先完成结构真实性验证。

2. 先做机制分类,再选实验路线

不同 circRNA 机制对应的实验路径并不相同。
例如:

  • ceRNA      / miRNA 海绵型 更重视双荧光素酶、Ago2-RIP 和 rescue

  • RBP      互作型 更重视 RNA pull-down、RIP 和蛋白鉴定

  • 翻译型      circRNA 更重视 ORF/IRES/翻译相关验证

  • 核内调控型 更重视定位、宿主基因表达、转录和剪接联动分析
         这种“先分类再做实验”的思路,正是近年 circRNA 综述和技术综述强调的主线。

3. 可覆盖从基础回环验证到深度机制解析的完整路线

从 divergent primer、RNase R 和 back-splice junction 测序,到 FISH、RIP、RNA pull-down、双荧光素酶和翻译潜能分析,可形成一套完整证据链,而不是碎片化实验堆叠。

4. 强调 circRNA 与宿主线性转录本的区分

circRNA 的实验设计必须注意避免把宿主基因线性转录本的变化误判为 circRNA 功能本身。近期 wet lab 技术综述明确指出,circRNA 的定量和功能研究应根据“是否需要同时关注线性转录本转移”来设计不同路线。

5. 适合从基础机制到转化研究的连续推进

既适合基础科研课题做机制挖掘,也适合疾病项目做标志物、药效相关研究,甚至进一步延伸到 circRNA 药物和 circRNA 疫苗等转化方向。


研究思路

做 circRNA 研究前,建议先回答四个问题。

1. 你要研究的是“表达变化”,还是“回环分子本身的作用机制”?

如果只是想找差异表达分子,表达筛选和验证即可;如果要做论文级机制研究,就必须进一步证明该分子真实存在、定位明确、具有功能并具备机制解释。

2. 这个 circRNA 更可能在核内还是胞质起作用?

胞质 circRNA 更常见于 miRNA 海绵、RBP 互作和翻译调控;核内 circRNA 更常与转录、剪接和宿主基因调控相关。近期对 circRNA 核输出机制的研究也说明,circRNA 的亚细胞分布并不是被动结果。

3. 你的机制问题更接近 miRNA、蛋白,还是翻译层?

如果它影响 miRNA/mRNA 轴,更偏 ceRNA;如果它结合 RBP 或形成复合体,更偏 RNA-蛋白互作;如果存在 ORF/IRES/m6A 相关翻译证据,则可能具有编码潜能。

4. 你是否已经把“环状”和“线性”区分清楚?

circRNA 研究中非常重要的一点,是明确当前 readout 来自环状分子本身,而不是宿主基因线性转录本。发散引物、RNase R 和回环测序是最基础的分流步骤。


circRNA 相关机制分类

下面这张表按机制逻辑而不是按实验名称分类,更适合您快速判断“自己当前更像哪一类 circRNA 问题”。

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circRNA 常用实验与机制对应矩阵

下表更偏向“机制问题—实验路线”的对应关系,适合您快速判断自己需要哪些实验组合。

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circRNA 研究应用场景总表

下表更偏“按疾病和课题方向选 circRNA 研究路线”。

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平台配套

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标准流程

客户提供方案 → 方案评估 → 正式报价 → 签订合同 → 支付预付款 → 开展实验 → 提交 PDF 版结果报告 → 支付尾款 → 提交完整报告

客户提交研究背景、研究目的、候选 circRNA、细胞/组织类型、预期机制方向及参考文献后,南京博恩将根据项目目标评估:

  • 当前问题更适合哪一类 circRNA 机制框架

  • 是否应优先做回环验证,再决定后续路线

  • 是否需要先做定位,再决定核内或胞质实验路径

  • 应采用哪些核心实验和哪些排他性验证

  • 是否需要功能实验与互作实验联动

  • 是否需要与动物实验、组织病理或药效研究结果衔接

项目完成后,可交付 PDF 版结果报告、完整终版报告、原始数据、统计图表、图注说明及整理后的发表级素材。


南京博恩生物技术有限公司面向高校、科研院所、医药企业和生物技术企业,提供覆盖 circRNA 表达筛选、回环结构验证、亚细胞定位、功能验证、circRNA-miRNA-mRNA 轴分析、RNA-蛋白互作、翻译潜能研究、转录与加工调控解析 的整体研究服务解决方案。公司围绕客户的具体研究问题,从 机制分类、结构验证、模型设计、指标组合、平台匹配到结果交付 进行系统设计,帮助客户把“一个差异表达的 circRNA”升级为更清晰、更可靠、更适合发表与转化的机制研究证据。
无论是肿瘤、炎症、纤维化、代谢疾病、神经系统疾病还是标志物与治疗转化研究,南京博恩都可围绕 circRNA 研究建立高质量、成体系的实验支持方案。



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