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RIP 实验服务
探索生命空间,助力基础研究

南京博恩生物技术有限公司面向高校、科研院所、医药企业与生物技术企业,提供从方案评估、抗体筛选、细胞裂解、免疫沉淀、RNA 纯化到 RIP-qPCR / RIP-PCR 分析的一站式 RIP 实验外包服务。服务覆盖 RNA 结合蛋白靶 RNA 鉴定、miRNA-mRNA 互作验证、lncRNA/circRNA 与蛋白互作研究、转录后调控机制验证、药物处理前后 RNA-蛋白互作变化分析及发表级数据整理。

RNA 免疫沉淀(RNA immunoprecipitation, RIP)是一种利用特异性抗体富集 RNA 结合蛋白及其结合 RNA 的技术,用于研究细胞内 RNA-蛋白相互作用。

交付包含原始 qPCR 数据、富集倍数分析结果、输入对照、IgG 对照、统计分析图及完整中文报告。
项目完成后提供终身售后支持,针对结果解释、图版整理、投稿补充材料准备及后续问题持续响应。


服务适用场景

本服务适用于 RNA 结合蛋白(RBP)靶 RNA 鉴定、miRNA 相关复合物研究、lncRNA/circRNA 结合蛋白验证、转录后调控机制分析、mRNA 稳定性调控研究、RNA 剪接与加工相关研究、药物处理前后 RNA-蛋白互作变化比较以及 RIP-seq 前的小范围候选 RNA 预验证。RIP 的经典用途,是验证某个 RNA 结合蛋白是否与特定 RNA 分子形成复合物。

适用客户类型

  • 高校与科研院所:RNA 调控机制研究、miRNA/lncRNA/circRNA      功能研究、论文机制数据补充

  • 医药企业:RNA 靶点作用机制验证、药物对 RNA-蛋白互作影响研究

  • 生物技术企业:RNA 结合蛋白功能验证、RNA 调控产品开发支持

适用研究方向

  • RNA 结合蛋白靶 RNA 鉴定

  • miRNA-mRNA 互作验证

  • lncRNA/circRNA 结合蛋白研究

  • mRNA 稳定性和转录后调控研究

  • RNA 剪接、运输和翻译调控研究

  • 药物干预前后 RNA-蛋白互作变化分析


RIP 常见认识误区

RIP 检测的是 RNA-蛋白互作,不是 DNA 结合,也不是蛋白-蛋白互作。
如果研究问题是:

  • 某 RNA 结合蛋白是否结合某个 mRNA /      lncRNA / circRNA:优先 RIP

  • 某蛋白是否结合启动子 DNA:优先 ChIP

  • 两个蛋白是否形成复合物:优先 Co-IP

  • 某 RNA 能拉下哪些蛋白:优先 RNA      pull-down

另一个常见误区,是把 RIP 当成“只要有抗体就能做”的实验。实际上 RIP 的成功高度依赖:

  • 抗体是否真正适合 RIP

  • RNA 是否完整、是否存在 RNase 污染

  • 裂解条件是否能保留 RNA-蛋白复合物

  • 是否设置了输入对照和 IgG 对照

  • 候选 RNA 的丰度是否足以被检测到


服务流程

客户发送方案 → 方案评估 → 问题反馈与优化 → 正式报价 → 签订合同 → 支付预付款 → 开始实验 → 提交 PDF 版结果报告 → 支付尾款 → 提交完整报告。

流程说明

1. 客户发送方案
提交研究目的、目标 RNA 结合蛋白、候选 RNA、样本类型、物种信息、处理条件及参考文献。

2. 方案评估
评估实验是否适合 RIP,确认是做 RIP-qPCR、RIP-PCR,还是 RIP-seq 前验证;同时评估抗体、RNA 提取策略和候选 RNA 是否可检测。

3. 问题反馈与优化
指出方案中可能存在的问题,如 RNA 易降解、抗体不适合 RIP、候选 RNA 丰度过低、研究问题更适合 RNA pull-down 或 CLIP、某些问题更适合原位杂交或荧光素酶验证等,并进行优化。

4. 正式报价
根据样本数量、目标蛋白数量、检测 RNA 数量、是否需 RNA 提取、是否需引物设计与验证、是否需重复实验和发表级图版整理等出具正式报价。

5. 签订合同并支付预付款
确认合作内容、周期及交付标准。

6. 开始实验
进入样本裂解、免疫沉淀、RNA 纯化、逆转录、qPCR 检测和数据分析流程。

7. 提交 PDF 结果报告
实验完成后先提交 PDF 版结果报告供客户确认。

8. 支付尾款并提交完整报告
尾款支付完成后,提交完整终版报告、原始 qPCR 数据、富集分析结果、统计图及整理版发表素材。


样本要求

RIP 对 RNA 完整性要求很高,因此样本处理必须尽量避免 RNase 污染,并尽量保留天然 RNA-蛋白复合物。

样本要求表

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样本说明

  • RIP 最怕 RNA 降解和 RNase 污染

  • RNA 结合蛋白表达量过低时,富集信号可能不足

  • 某些瞬时或弱互作可能需要特殊优化

  • 组织样本比细胞样本更依赖裂解条件和背景控制。


交付内容

交付内容包含中文版实验报告、样本信息、抗体信息、实验方法、RNA 提取与逆转录说明、输入对照说明、IgG 对照说明、原始 qPCR 数据、富集倍数分析结果、统计分析图、图注、结果描述、结论总结及完整终版报告。

标准交付清单

  • 中文版实验报告

  • 样本与抗体信息

  • 实验方法学描述

  • RNA 提取与逆转录说明

  • 原始 qPCR 数据

  • 输入对照结果

  • IgG 对照结果

  • 富集倍数分析结果

  • 统计分析图

  • 图注与结果说明

  • 发表级图版整理

  • 完整终版报告

售后支持

项目完成后提供终身售后支持,包括:

  • 结果解释

  • 对照设置说明

  • 图版整理

  • 投稿补充材料支持

  • 后续答疑与补充说明


周期与报价方式

常规 RIP-qPCR 项目周期通常为 20–30 个工作日。涉及低表达 RNA、复杂组织样本、多 RNA 位点检测、引物设计与验证、重复实验或发表级图版整理的项目周期相应延长。与普通 qPCR 相比,RIP 的上游样本制备和免疫沉淀步骤更复杂,因此前期评估和对照设置尤为关键。

报价因素

  • 样本数量

  • 目标 RNA 结合蛋白数量

  • 检测 RNA 数量

  • 是否需 RNA 提取与逆转录

  • 是否需引物设计与验证

  • 是否需重复实验

  • 是否需统计分析与发表级图版整理


常见问题

RIP 主要检测什么?
RIP
主要检测 RNA 结合蛋白与 RNA 的相互作用,用于判断某个 RBP 是否结合某个 RNA,或在何种处理条件下结合是否变化。

RIP 和 RNA pull-down 有什么区别?
RIP
是从蛋白角度出发,用抗体富集 RNA 结合蛋白,再检测其结合 RNA;RNA pull-down 是从RNA 角度出发,用标记 RNA 作为诱饵去拉下结合蛋白。二者常互补使用。

RIP 和 ChIP 有什么区别?
ChIP
检测的是蛋白—DNA 结合;RIP 检测的是蛋白—RNA 结合。前者更适合转录调控研究,后者更适合转录后调控研究。

RIP 可以用于 miRNA 靶基因验证吗?
可以。一个常见策略是检测 Ago2 复合物中是否富集候选 mRNA 或 miRNA,从而支持 miRNA 相关调控复合物的存在。

结果是否可直接用于发表?
交付包含原始 qPCR 数据、输入对照、IgG 对照、富集分析图、图注说明及整理版图版,可直接用于论文、汇报和结题材料整理。


RIP 原理

RIP 的核心原理是利用 RNA 结合蛋白特异性抗体,将 RNA-蛋白复合物免疫沉淀下来,然后纯化 RNA 并通过 qPCR、PCR 或测序分析其组成,从而确定 RNA-蛋白相互作用。


RIP 实验步骤

1. 样本裂解

采用尽量温和、同时具备 RNase 抑制保护的裂解体系制备样本,释放 RNA-蛋白复合物。
RIP 比普通 RNA 提取更强调保留天然 RNA-蛋白复合物。

2. 免疫沉淀

加入目标 RNA 结合蛋白抗体和 Protein A/G 磁珠或琼脂糖珠,富集 RNA-蛋白复合物。抗体是否适合 RIP 是关键。

3. 洗涤

去除非特异性背景,保留特异性沉淀复合物。

4. RNA 纯化

从免疫沉淀复合物中提取 RNA,去除蛋白和杂质,进入下游逆转录与检测流程。

5. 逆转录

将提取到的 RNA 逆转录为 cDNA,用于后续 qPCR 或 PCR 分析。

6. qPCR / PCR 检测

针对候选 RNA 设计引物,检测其在目标抗体组中的富集程度,并与输入对照、IgG 对照比较。

7. 数据分析

常见输出包括 percent input、fold enrichment 或相对富集结果,并结合阳性/阴性 RNA 进行解释。


RIP 常见应用场景

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RIP 与相关实验的应用区别

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技术选择逻辑

  • 研究 某 RNA 结合蛋白是否结合某 RNA:优先      RIP

  • 研究 某 RNA 能拉下哪些蛋白:优先 RNA pull-down

  • 研究 某蛋白是否结合到某段 DNA:优先 ChIP

  • 研究 两个蛋白是否形成复合物:优先 Co-IP

  • 研究 RNA 在细胞或组织中位于哪里:优先 原位杂交

  • 研究 某 3'UTR 或调控片段是否具有功能活性:优先 荧光素酶报告基因


常见 RNA 结合蛋白研究对象

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南京博恩生物技术有限公司提供面向科研客户与医药企业的 RIP 实验外包服务,覆盖 RNA-蛋白互作验证、RNA 结合蛋白靶 RNA 鉴定、miRNA-mRNA 互作研究、lncRNA/circRNA 与蛋白互作分析及发表级数据整理。项目交付包含原始 qPCR 数据、输入对照、IgG 对照、富集分析图及完整中文报告,并提供终身售后支持。
客户提交方案后,项目按“方案评估—问题反馈—报价签约—实验执行—PDF 结果确认—完整报告交付”的标准流程推进。交付结果可直接用于课题研究、论文整理、项目申报与结题汇报。







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