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南京博恩生物技术有限公司面向高校、科研院所、医药企业与生物技术企业,提供荧光素酶报告基因实验一站式技术服务。服务内容覆盖方案评估、载体设计、片段克隆、细胞转染、双荧光素酶检测、数据分析及中文报告整理,可用于启动子活性研究、增强子功能分析、顺式作用元件验证、转录因子调控验证、miRNA 靶位点验证、信号通路转录活性检测及突变体比较分析等研究方向。

荧光素酶报告基因实验的核心原理,是将待研究的启动子、增强子、结合位点、响应元件或 3'UTR 序列构建到报告载体中,通过检测荧光素酶发光强度变化,间接反映相关调控元件对转录或翻译过程的影响。项目交付内容包括原始发光读数、归一化结果表、统计分析图及完整中文报告,并支持后续结果解释、图版整理及补充材料准备。

导读

一、服务概述
二、我们的服务优势
三、本服务可解决的核心研究问题
四、适用客户与研究方向
五、客户需提供的信息
六、交付成果与售后支持
七、项目周期与报价影响因素
八、常见问题
九、博恩优势
附录A 方法适用边界与结果解读说明
附录B 常见构建设计说明
附录C 实验流程
附录D 常见应用类型
附录E 荧光素酶结果解读指南
附录F 荧光素酶报告基因与其他技术的应用区别
附录G 常见构建体系说明
附录H 实验质控与结果可靠性保障
附录I 常用生物信息分析工具网站


一、服务概述

南京博恩生物技术有限公司面向高校、科研院所、医药企业与生物技术企业,提供荧光素酶报告基因实验一站式技术服务。服务内容覆盖方案评估、载体设计、片段克隆、细胞转染、双荧光素酶检测、数据分析及中文报告整理,可用于启动子活性研究、增强子功能分析、顺式作用元件验证、转录因子调控验证、miRNA 靶位点验证、信号通路转录活性检测及突变体比较分析等研究方向。

荧光素酶报告基因实验的核心原理,是将待研究的启动子、增强子、结合位点、响应元件或 3'UTR 序列构建到报告载体中,通过检测荧光素酶发光强度变化,间接反映相关调控元件对转录或翻译过程的影响。项目交付内容包括原始发光读数、归一化结果表、统计分析图及完整中文报告,并支持后续结果解释、图版整理及补充材料准备。


二、我们的服务优势

2.1 提供从方案评估到结果交付的一站式服务

项目实施覆盖实验设计评估、载体构建、细胞转染、双荧光素酶检测、数据归一化分析及报告整理等完整流程,能够满足科研项目、论文机制研究、药物作用机制验证及企业研发评估等不同场景需求。

2.2 具备复杂实验设计与优化能力

针对不同研究目的,可设计启动子全长、截短体、位点突变体、3'UTR-WT/Mut、转录因子共转染体系、miRNA mimic 或 inhibitor 体系以及通路响应元件检测体系,并结合细胞背景、处理条件和研究问题对实验路线进行优化。

2.3 强调数据质量控制与结果可靠性

项目执行过程中重视载体构建准确性、插入片段设计合理性、测序确认、细胞状态控制、转染条件优化、内参校正及统计分析规范性,以提高实验结果的稳定性、可重复性和可解释性。

2.4 明确方法边界并提供联合验证建议

荧光素酶报告基因实验适合评估调控片段是否影响转录或翻译输出,可用于提供功能层面的证据。对于需要证明体内或体外直接结合的研究,可根据课题目的建议联合 ChIP、EMSA、RIP、RNA pull-down、DNA pull-down 等实验技术进行补充验证。

2.5 交付结果便于科研整理与对外展示

项目完成后可提供原始读数、Firefly/Renilla 归一化结果表、统计图、图注说明及完整中文报告,并支持发表级图版整理,便于用于论文撰写、课题汇报、项目申报及结题材料准备。


三、本服务可解决的核心研究问题

3.1 启动子与增强子功能研究

适用于目标基因启动子区域活性分析、增强子功能验证及顺式作用元件筛选,可通过不同构建体间的活性差异判断关键功能区域。

3.2 转录因子调控验证

适用于研究特定转录因子是否影响某启动子或调控片段的转录活性,可结合转录因子表达载体共转染体系进行功能验证。

3.3 miRNA 靶位点验证

适用于验证 miRNA 是否通过特定 3'UTR 位点影响报告信号活性,常通过野生型与突变型载体比较,并结合 mimic 或 inhibitor 处理进行分析。

3.4 信号通路转录活性检测

适用于 NF-κB、CRE、STAT、HIF、Wnt/β-catenin 及其他经典信号通路响应元件的转录活性检测,可用于药物刺激、通路激活或抑制后的活性比较。

3.5 突变位点与功能区段分析

适用于通过截短体构建、单点或多点突变设计,对启动子、增强子或结合位点中的关键功能区域进行定位与验证。


四、适用客户与研究方向

4.1 高校与科研院所

适用于启动子功能研究、转录调控验证、miRNA 靶向机制研究、通路活性分析及论文机制数据补充。

4.2 医药企业

适用于药物对信号通路转录活性的影响评估、候选靶点调控机制研究及药效机制验证。

4.3 生物技术企业

适用于顺式元件筛选、产品功能验证、细胞模型信号输出体系建立及研发阶段的功能分析支持。

4.4 常见研究方向

包括启动子或增强子活性研究、转录因子调控验证、miRNA 与 3'UTR 靶向关系验证、响应元件功能分析、突变位点验证及药物刺激前后转录活性变化研究。


五、客户需提供的信息

5.1 启动子活性检测项目

通常需提供目标基因启动子区域信息或候选序列。实验中常将目标片段构建于 Firefly luciferase 载体上游,以评估其转录驱动能力。

5.2 增强子或顺式元件验证项目

通常需提供候选增强子片段或 motif 序列。实验设计常包含野生型与突变型比较,以判断特定位点的功能意义。

5.3 miRNA 靶位点验证项目

通常需提供目标 3'UTR 序列及候选结合位点信息。实验中常设置 3'UTR-WT 与 3'UTR-Mut 双构建,并配合 mimic 或 inhibitor 进行功能验证。

5.4 转录因子调控验证项目

通常需提供候选转录因子信息、结合位点、相关表达载体信息及实验背景条件。此类项目一般采用报告载体与表达载体共转染的方式进行分析。

5.5 通路活性检测项目

通常需提供目标通路类型、预期响应元件、细胞模型及处理条件。常见检测对象包括 NF-κB、CRE、HRE、TCF/LEF 等响应元件。

5.6 客户基础信息要求

为便于构建设计与实验路线规划,通常还需提供物种信息、基因名称、目标序列、细胞系、处理条件及参考文献信息。


六、交付成果与售后支持

6.1 标准交付内容

项目标准交付内容包括中文版实验报告、载体与插入片段信息、实验方法学描述、原始发光读数、Firefly/Renilla 归一化结果表、统计分析图、图注与结果说明、完整终版报告及整理后的发表素材。

6.2 结果使用场景

交付结果可用于论文撰写、课题汇报、项目申报、结题材料整理及企业内部研发评估。

6.3 售后支持内容

项目完成后提供持续售后支持,包括结果解释、载体设计说明、图版整理、问题答疑及补充说明等服务。


七、项目周期与报价影响因素

7.1 项目周期

常规荧光素酶报告基因项目周期通常为 15—30 个工作日。若项目涉及多构建体设计、野生型与突变型比较、双细胞系验证、转录因子共转染、miRNA 模拟物或抑制物处理、药物刺激及发表级图版整理,项目周期将相应延长。

7.2 报价影响因素

项目报价通常根据构建体数量、是否需要野生型与突变型成对设计、是否需要截短体构建、是否需要共转染表达载体或 miRNA、细胞系数量、是否涉及药物处理、是否需要重复实验与统计分析、是否需要发表级图版整理等因素综合评估。


八、常见问题

8.1 荧光素酶报告基因主要检测什么

主要检测启动子、增强子、响应元件或 3'UTR 片段在细胞中的调控结果,输出通常表现为相对发光强度变化。

8.2 荧光素酶报告基因能否直接证明转录因子结合启动子

该方法更适合判断某调控片段是否具有功能活性,或某位点突变后活性是否发生变化。若研究目标是证明蛋白是否直接结合 DNA,通常仍需配合 ChIP 或 EMSA。

8.3 双荧光素酶为什么要设置两个报告信号

第二个报告信号通常用于内参校正,以减少转染效率、细胞状态及实验操作波动对结果的影响。

8.4 荧光素酶报告基因与 qPCR 的区别是什么

qPCR 检测的是内源 mRNA 的表达水平变化,而荧光素酶报告基因检测的是某个构建片段驱动报告信号表达的能力。前者更偏向内源表达检测,后者更偏向调控片段功能验证。

8.5 结果是否可直接用于论文或项目材料整理

项目交付内容包含原始读数、归一化结果表、统计图、图注说明及整理版图表,可直接用于论文、汇报及相关研究材料准备。


九、博恩优势

南京博恩生物技术有限公司提供面向科研客户与医药企业的荧光素酶报告基因实验服务,能够围绕启动子活性检测、增强子功能分析、转录因子调控验证、miRNA 靶位点研究及信号通路转录活性检测等需求,提供从前期方案评估到后期结果交付的完整技术支持。项目实施过程中兼顾实验设计、质量控制、结果解释与材料整理,可为客户提供更规范、更清晰、更具可用性的实验数据与报告成果。


附录A 方法适用边界与结果解读说明

A1 方法适用边界

荧光素酶报告基因实验检测的是调控结果,可用于反映功能输出变化。某启动子活性升高,说明该片段在当前实验体系中增强了转录输出;某转录因子过表达后报告信号活性升高,说明其可能促进该片段相关的转录活性;某 miRNA 与野生型 3'UTR 共转染后信号下降,则提示该位点可能参与负调控过程。

A2 结果解读原则

这类结果本身不能单独证明转录因子一定直接结合目标 DNA,也不能单独证明 miRNA 一定直接结合某个 RNA 位点。若研究目的在于证明结合关系、结合位点特异性或体内真实相互作用,通常还需要结合 ChIP、EMSA、RIP、RNA pull-down、DNA pull-down 等实验方法进一步验证。

A3 适用定位

因此,荧光素酶报告基因更适合用于功能活性评估和机制线索验证,适合作为证据链中的功能验证环节。


附录B 常见构建设计说明

B1 启动子活性检测项目设计

片段长度越长,构建难度和结果解释复杂度通常越高。启动子研究常设置空载体、全长片段、截短片段及突变片段,以提高功能区段分析的准确性。

B2 miRNA 靶位点验证项目设计

miRNA 研究常设置野生型与突变型 3'UTR 载体,并联合 mimic 或 inhibitor 进行功能验证,以判断位点依赖性。

B3 双荧光素酶体系设计

双荧光素酶体系通常采用 Firefly 作为实验报告信号,Renilla 作为内参信号,以提高数据稳定性和比较可靠性。


附录C 实验流程

C1 方案提交

客户提交研究目的、目标基因或调控序列信息、候选转录因子或 miRNA、物种信息、细胞系、处理条件及参考文献等资料。

C2 方案评估

根据研究目标判断项目是否适合采用荧光素酶报告基因实验,并明确实验类型、构建方式、检测体系及必要的对照设置。

C3 问题反馈与优化

对可能影响实验结果的问题进行评估与反馈,例如片段设计过长、突变位点设置不合理、细胞系不适合目标通路信号输出检测,或实验设计不足以支撑直接结合结论等,并提出优化建议。

C4 正式报价与合作确认

根据构建数量、是否包含野生型与突变型成对设计、是否需要共转染、药物刺激、重复实验及图版整理等内容形成正式报价,并确认合作范围、周期及交付标准。

C5 实验实施

进入载体构建、菌落筛选、测序确认、细胞转染、处理培养、双荧光素酶检测及数据分析等实验流程。

C6 阶段性结果提交

实验完成后先提交 PDF 版结果报告,供客户进行阶段性确认。

C7 完整结果交付

项目结项后提交完整终版报告、原始读数、归一化结果表、统计分析图及整理后的发表素材。


附录D 常见应用类型

D1 启动子活性检测

主要用于评估基因启动子区域是否具有转录驱动能力,常见输出为相对发光强度变化。

D2 增强子或顺式元件功能验证

主要用于比较野生型与突变型片段之间的活性差异,以判断候选位点是否具有功能作用。

D3 转录因子调控验证

通过分析转录因子过表达或干预后报告信号活性的变化,评估其对目标调控片段的影响。

D4 miRNA 靶位点验证

通过 3'UTR-WT/Mut 体系联合 mimic 或 inhibitor 处理,观察报告信号活性变化,以判断调控是否依赖特定位点。

D5 通路活性检测

通过 NF-κB、CRE、HRE、TCF/LEF 等响应元件检测刺激或抑制条件下的活性变化,用于通路研究和药效评价。

D6 截短体与突变体分析

通过不同长度片段或特定位点突变构建,定位关键功能区段并判断突变对活性的影响。


附录E 荧光素酶结果解读指南

E1 先看原始读数是否基本合理

原始读数通常包括 Firefly 和 Renilla 两部分。首先应观察各组原始发光值是否处于可检测范围内,重复孔之间差异是否过大,是否存在个别数值明显异常、背景过高或整体信号过低等情况。原始读数主要用于判断实验是否存在明显技术问题,一般不直接作为最终结论依据。

E2 重点看归一化结果

双荧光素酶实验中,通常以 Firefly/Renilla 比值作为最终分析基础。Firefly 反映目标调控片段驱动的信号变化,Renilla 主要用于校正转染效率、细胞状态及操作波动带来的差异。因此,结果解读时应重点看归一化后的相对活性。

E3 先判断对照组是否设置合理

结果分析前应确认实验是否设置了合适对照。例如启动子实验通常需要空载体对照、全长或截短体对照;miRNA 实验通常需要 WT 与 Mut 对照、mimic NC 或 inhibitor NC 对照;转录因子实验通常需要报告载体单独组和空表达载体组。只有对照组设置完整,结果差异才具有较强解释意义。

E4 关注变化方向和变化幅度

若某组归一化活性较对照组明显升高,通常说明该处理、该片段或该因子可能增强了报告输出;若明显降低,则提示其可能抑制报告活性。变化方向反映调控趋势,变化幅度有助于判断作用强弱。

E5 结合统计学结果判断差异是否可靠

实验结果不能只凭柱状图高低作判断,还应结合重复实验和统计学分析结果进行解释。若组间差异具有统计学意义且重复实验趋势一致,则说明结果更具可靠性。若差异幅度较小、重复间波动较大或统计学不显著,则应谨慎下结论,必要时优化实验条件或增加重复验证。

E6 不同实验类型的常见解读方式

E6.1 启动子活性实验

若启动子载体组活性高于空载体组,通常说明该启动子片段具有转录驱动能力。若截短体之间活性出现明显差异,则提示不同区段可能包含正调控或负调控元件。若位点突变后活性下降,通常提示该位点可能参与转录激活;若突变后活性升高,则提示该位点可能参与负调控。

E6.2 增强子或顺式元件实验

若候选增强子片段能显著提高报告信号活性,说明该片段在当前体系下可能具有增强作用。若 motif 突变后活性减弱或消失,则提示该位点可能是功能关键位点。

E6.3 转录因子调控实验

若转录因子共转染后报告信号活性升高,说明该转录因子可能促进该调控片段介导的转录输出;若活性降低,则提示其可能发挥抑制作用。此类结果属于功能层面的支持证据。

E6.4 miRNA 靶位点验证实验

若 miRNA mimic 与 WT 3'UTR 共转染后报告信号活性下降,而在 Mut 3'UTR 中这种下降明显减弱或消失,则通常支持该 miRNA 对该位点具有靶向调控作用。若 inhibitor 处理后 WT 组活性回升,也可进一步增强这种解释。

E6.5 通路活性检测实验

若刺激处理后通路响应元件报告信号活性升高,通常说明相关通路被激活;若抑制剂处理后活性下降,则提示通路活性受到抑制。此类结果常用于药物作用评估和机制研究,但仍需结合细胞背景和其他验证实验综合判断。

E7 结果解读时避免过度外推

荧光素酶报告基因实验本质上反映的是构建体系中的功能输出,不能直接等同于内源基因在体内的全部调控状态。结果升高或降低,通常说明该片段在当前细胞和处理条件下具有相应调控作用。更稳妥的表述可使用“提示”“支持”“说明可能参与调控”等表达。

E8 判断结果是否适合继续推进

若结果趋势清晰、对照合理、重复性较好且统计学显著,通常可支持进入后续机制验证或论文数据整理阶段。若结果波动大、组间差异不清晰或对照不完整,则建议回到构建设计、细胞模型、处理条件或重复次数等环节进一步优化。


附录F 荧光素酶报告基因与其他技术的应用区别

F1 从研究目的看

荧光素酶报告基因实验更侧重功能输出,主要回答启动子、增强子、响应元件或 3'UTR 片段是否会影响报告信号表达输出。该技术尤其适合用于启动子活性分析、增强子功能验证、miRNA 靶位点验证、信号通路活性检测以及野生型与突变型片段功能比较。

F2 从证据类型看

荧光素酶报告基因提供的是功能证据,可用于回答是否存在功能变化、位点突变后功能是否改变等问题。对于是否发生物理结合、是否在细胞内真实占位等问题,通常需要其他技术补充。

F3 与常见相关技术的区别

F3.1 与 ChIP 的区别

ChIP 主要用于研究蛋白与 DNA 的体内结合关系,强调体内真实染色质环境中的结合证据。荧光素酶报告基因更关注某段启动子或调控序列是否具有功能活性。两者在研究转录因子调控时通常具有互补性。

F3.2 与 EMSA 的区别

EMSA 主要用于研究蛋白与 DNA 的直接结合能力,适用于 motif 结合验证和体外结合分析。荧光素酶报告基因用于反映 DNA 片段在细胞中的功能表现。前者更偏向体外直接结合证据,后者更偏向细胞内功能输出。

F3.3 与 RIP 的区别

RIP 主要用于研究 RNA 结合蛋白与 RNA 的结合关系,强调蛋白与 RNA 相互作用证据。荧光素酶报告基因更多用于分析 miRNA 与 3'UTR 位点之间的功能关系,或 RNA 相关调控是否会改变报告信号输出。

F3.4 与 RNA pull-down 的区别

RNA pull-down 以 RNA 为诱饵,主要用于筛选可能与其结合的蛋白,适合用于 lncRNA、circRNA 等分子机制研究。荧光素酶报告基因更适合验证某段 RNA 相关序列是否影响报告信号表达。

F3.5 与 DNA pull-down 的区别

DNA pull-down 以 DNA 片段为诱饵,主要用于筛选可能与特定 DNA 序列结合的蛋白。荧光素酶报告基因更关注该 DNA 片段是否具有调控活性。

F3.6 与原位杂交的区别

原位杂交主要用于研究核酸在组织或细胞中的空间定位,关注位置和分布。荧光素酶报告基因主要反映功能输出强弱。

F4 从实验应用逻辑看

在实际研究中,荧光素酶报告基因常用于机制研究中的功能验证阶段。研究者可先通过生信分析预测某个转录因子结合位点或 miRNA 靶位点,再利用荧光素酶实验验证该位点在功能上是否成立。若需要进一步证明直接结合关系,则可继续结合 ChIP、EMSA、RIP 或 pull-down 类实验做更深入验证。

F5 从技术选择看

若研究目的是判断启动子、增强子、响应元件或 3'UTR 是否具有功能活性,应优先考虑荧光素酶报告基因实验。若研究目的是判断某蛋白是否在细胞内结合特定 DNA 区域,应优先考虑 ChIP。若研究目的是验证蛋白是否能直接结合某段 DNA motif,应优先考虑 EMSA。若研究目的是研究蛋白与 RNA 的结合关系,可优先考虑 RIP。若研究目的是筛选 RNA 或 DNA 的结合蛋白,则更适合采用 RNA pull-down 或 DNA pull-down。若研究目的是观察核酸在组织或细胞中的分布位置,则应优先考虑原位杂交。


附录G 常见构建体系说明

G1 启动子全长载体

适用于初步评估目标启动子的整体转录驱动能力,常与空载体和内参载体配合使用。

G2 启动子截短载体

适用于定位关键功能区段,通过不同长度启动子片段之间的比较判断活性保留区域和活性缺失区域。

G3 位点突变载体

适用于验证特定位点功能,通过野生型与突变型之间的活性差异判断 motif 是否参与调控。

G4 3'UTR-WT 与 3'UTR-Mut 载体

适用于 miRNA 靶位点验证。若突变后抑制作用消失,通常提示该位点与调控过程相关。

G5 响应元件载体

适用于 NF-κB、CRE、HRE、TCF/LEF 等信号通路转录活性检测,可用于分析刺激、抑制或药物处理后的活性变化。

G6 共转染表达载体体系

适用于验证特定转录因子是否影响报告信号活性,常设置报告载体单独组与空表达载体组作为对照。

G7 miRNA 共转染体系

适用于验证 miRNA 调控作用,通常设置 mimic NC、inhibitor NC 及 WT/Mut 组合体系,以提高结果解释的完整性。

G8 双荧光素酶体系

采用 Firefly 报告信号与 Renilla 内参的组合方式,以降低转染效率差异和细胞状态波动对结果的影响。结果解读时应重点关注归一化后的分析结果。


附录H 实验质控与结果可靠性保障

H1 构建阶段质控

项目执行中重视实验设计合理性与结果解释完整性。

H2 实验阶段质控

实验阶段重视细胞状态、转染条件、处理方案及检测窗口的优化,尽量减少技术波动对结果的影响,提高不同组别之间的可比性。

H3 数据分析阶段质控

数据分析阶段强调内参校正、对照组设置、重复实验及统计分析规范,确保结果具备较好的稳定性、可重复性与解释价值。

H4 不同研究类型的建议设置

对于启动子研究,通常建议设置空载体、全长、截短体及位点突变体,以提高功能区段分析的准确性。对于 miRNA 研究,通常建议设置 3'UTR-WT、3'UTR-Mut 及 mimic 或 inhibitor 联合体系,以验证位点依赖性。对于通路活性研究,通常建议设置响应元件报告载体、刺激剂或抑制剂及内参体系,以获得更具解释力的检测结果。


附录I 常用生物信息分析工具网站

I1 常用启动子与转录因子分析工具网站

I1.1 JASPAR

JASPAR 是常用的转录因子结合位点数据库,提供人工整理的、非冗余的转录因子结合谱,可用于转录因子结合位点检索、启动子序列扫描和 motif 分析。适合用于预测候选转录因子、分析结合基序及辅助启动子功能研究。

I1.2 AnimalTFDB

AnimalTFDB 是常用的动物转录因子数据库,可用于查询转录因子家族分类、转录辅因子信息及物种层面的注释结果。适合用于目标基因上游潜在转录因子的初步筛选,以及转录因子背景信息整理。

I1.3 UCSC Genome Browser

UCSC Genome Browser 适合用于查看基因组区域、转录起始位点、CpG 岛、保守性、转录因子相关注释轨道及公共功能组学数据,也可配合 Table Browser 导出目标区域信息,常用于启动子区域定位和上游序列整理。

I1.4 MEME Suite

MEME Suite 是常用的 motif 分析平台,支持序列中保守基序发现、已知基序扫描及富集分析,常用于启动子序列 motif 挖掘、候选结合位点筛选和转录因子结合模式分析。

I2 常用 miRNA、lncRNA、circRNA 的 ceRNA 网络分析工具网站

I2.1 miRNet

miRNet 是常用的 miRNA 调控网络分析平台,支持 miRNA、基因、ncRNA、转录因子等多类型分子输入,并可进行网络构建、可视化和功能分析。适合用于 ceRNA 网络的初步构建与结果展示。

I2.2 DIANA-LncBase

DIANA-LncBase 是常用的 miRNA-lncRNA 相互作用数据库,收录了大量实验支持的 miRNA 与非编码转录本互作信息,适合用于 ceRNA 分析中 lncRNA 与 miRNA 关系的筛选和验证。

I2.3 ENCORI(starBase)

ENCORI 是常用的 RNA 互作分析平台,可用于查询 miRNA、lncRNA、circRNA、mRNA 等分子之间的相互作用关系,也提供 ceRNA 网络相关分析入口,适合用于多类型 RNA 互作关系整合分析。

I2.4 circBank

circBank 是常用的 circRNA 数据库与分析平台,可用于 circRNA 注释、序列查询、潜在 miRNA 结合信息检索及相关分析,适合用于 ceRNA 网络中 circRNA 节点的筛选与补充分析。

 


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