南京博恩生物技术有限公司面向高校、科研院所、医药企业与生物技术企业，提供从方案评估、探针设计、样本前处理、杂交检测、成像分析到结果解读的一站式原位杂交实验外包服务。服务覆盖 RNA 原位杂交、RNA FISH、组织切片原位杂交、石蜡切片 RNA-ISH、冰冻切片 RNA-ISH、DNA FISH、荧光原位杂交、染色体/基因位点定位分析、mRNA 空间表达分析、多重 RNA 原位检测及发表级图版整理。

原位杂交是一类利用核酸探针与样本中目标核酸序列特异性杂交，从而在细胞或组织原位检测 RNA 或 DNA 的技术。

交付包含原始染色/荧光图、代表性视野图、定位分析图、半定量或定量分析结果及完整中文报告。
项目完成后提供终身售后支持，针对结果解释、图版整理、投稿补充材料准备及后续问题持续响应。

服务适用场景

本服务适用于组织和细胞中目标 RNA 的空间定位分析、特定基因在组织中的表达分布研究、病理样本中核酸标志物检测、基因位点定位、染色体异常检测、剪接变体检测、融合转录本检测、突变位点原位验证、肿瘤组织空间表达分析、发育与分化研究、神经系统和免疫微环境研究等。

与 qPCR 相比，原位杂交不仅能告诉你“是否表达”，更能告诉你“在哪些细胞中表达、在组织的哪个区域表达、表达是否具有空间异质性”。

适用客户类型

• 高校与科研院所：组织空间表达研究、发育生物学研究、论文配图、结题材料整理

• 医药企业：组织标志物定位、空间转化研究、病理样本验证

• 生物技术企业：探针应用验证、组织分型支持、空间表达评估

适用研究方向

• 组织中 mRNA 空间表达分析

• 细胞内 RNA 定位研究

• 基因位点与染色体异常检测

• 融合转录本、剪接变体与点突变检测

• 肿瘤空间异质性研究

• 发育、神经和病理样本研究

原位杂交常见认识误区

原位杂交检测的是 核酸，不是蛋白。
它适合回答的是：

• 目标 RNA /      DNA 是否在样本中存在

• 它存在于哪些细胞中

• 它位于组织的哪个区域

• 它是否表现出空间异质性

• 是否能在原位看到融合转录本、短片段、剪接变体或突变相关信号

它不直接回答：

• 蛋白是否表达

• 蛋白是否发生磷酸化、切割或修饰

• 蛋白是否与另一蛋白结合

• 某个转录因子是否直接结合到启动子
       这些问题通常分别更对应免疫组化/免疫荧光、Western      blot、Co-IP 和 ChIP/EMSA。

另一个常见误区是把所有原位杂交都理解为“普通 RNA 定位”。实际上不同平台用途差异很大：

• 常规 RNA-ISH      / RNA FISH：适合 RNA 定位与表达分析

• RNAscope：强调高灵敏度和空间转录表达分析

• BaseScope：更适合检测短 RNA      片段、剪接变体、外显子连接位点、融合和点突变相关序列

• DNA FISH：更适合染色体/基因位点定位与基因扩增/缺失研究
       Bio-Techne / ACD 对 BaseScope 的官方说明就明确指出，它适合 50–300 bases 的短 RNA、splice variants、point mutations 和 gene fusion 检测。

服务流程

客户发送方案 → 方案评估 → 问题反馈与优化 → 正式报价 → 签订合同 → 支付预付款 → 开始实验 → 提交 PDF 版结果报告 → 支付尾款 → 提交完整报告。

流程说明

1. 客户发送方案
提交研究目的、目标 RNA / DNA、样本类型、物种信息、组织来源、分组设计及参考文献。

2. 方案评估
评估检测对象是否适合原位杂交，确认采用 RNA-ISH、RNA FISH、DNA FISH、RNAscope、BaseScope 或其他特定原位杂交路线，并确定探针策略和成像方式。

3. 问题反馈与优化
指出方案中可能存在的问题，如目标更适合 qPCR 而非原位、样本保存条件不适合 RNA 检测、目标片段过短/高度同源需改用 BaseScope、融合或剪接位点检测需重新定义探针区域等，并进行优化。

4. 正式报价
根据样本数量、探针数量、单靶标或多靶标、是否需组织切片前处理、是否需荧光成像、是否需定量分析和发表级图版整理等出具正式报价。

5. 签订合同并支付预付款
确认合作内容、周期及交付标准。

6. 开始实验
进入样本固定、切片前处理、探针杂交、信号放大、显色或荧光检测、显微成像和数据分析流程。

7. 提交 PDF 结果报告
实验完成后先提交 PDF 版结果报告供客户确认。

8. 支付尾款并提交完整报告
尾款支付完成后，提交完整终版报告、原始图、代表图、定位分析图、统计图及整理版发表素材。

样本要求

原位杂交对样本保存和核酸完整性要求较高。

样本要求表

样本说明

• RNA 原位杂交特别怕      RNase 污染

• FFPE 样本适合多数临床和病理相关研究，但需关注核酸保存质量

• 剪接变体、融合位点、点突变等特殊目标需提前评估探针可行性

• 多重原位杂交需提前规划靶标数量与成像策略

交付内容

交付内容包含中文版实验报告、样本信息、探针信息、实验方法、显色或荧光体系说明、成像参数、代表性视野图、定位分析图、半定量或定量统计图、图注、结果描述、结论总结及完整终版报告。

标准交付清单

• 中文版实验报告

• 样本与探针信息

• 实验方法学描述

• 代表性视野图片

• 定位分析图

• 半定量或定量统计图

• 图注与结果说明

• 发表级图版整理

• 完整终版报告

售后支持

项目完成后提供终身售后支持，包括：

• 结果解释

• 定位与空间表达说明

• 图版整理

• 投稿补充材料支持

• 后续答疑与补充说明

周期与报价方式

常规原位杂交项目周期通常为 30–45个工作日。涉及新探针设计、特殊靶标检测、多靶标原位杂交、融合/突变/剪接体检测、荧光原位杂交、高级图像分析或发表级图版整理的项目周期相应延长。

报价因素

• 样本数量

• 探针数量

• 单靶标或多靶标

• 是否为 RNA-ISH、RNA FISH、DNA FISH、RNAscope 或 BaseScope

• 是否需组织包埋与切片

• 是否需空间定量分析

• 是否需发表级图像整理

常见问题

原位杂交主要检测什么？
原位杂交主要检测特定 RNA 或 DNA 在细胞和组织中的存在、定位和空间分布。

原位杂交和 qPCR 的区别是什么？
qPCR 更适合检测总体表达量变化；原位杂交更适合看空间定位和组织异质性。前者偏“总量定量”，后者偏“原位可视化”。

原位杂交和免疫组化/免疫荧光的区别是什么？
原位杂交检测核酸，免疫组化和免疫荧光检测蛋白。若研究重点是 RNA 定位，优先原位杂交；若重点是蛋白定位，优先 IHC/IF。

原位杂交能检测剪接变体或点突变吗？
可以，但通常需使用更适合短序列和位点特异检测的平台，如 BaseScope。

结果是否可直接用于发表？
交付包含原始图、代表图、统计图、图注说明及整理版图版，可直接用于论文配图、结题材料与项目汇报。

原位杂交原理

原位杂交通过带标记的核酸探针与样本中的目标核酸序列发生特异性杂交，再通过显色或荧光信号将目标序列可视化，从而在保留组织和细胞结构背景的前提下观察核酸分布。

原位杂交实验步骤

1. 样本固定

固定用于保持组织或细胞结构并保护核酸完整性。

2. 包埋与切片

根据实验路线进行石蜡包埋或冰冻包埋，并制备适合原位检测的切片。

3. 前处理

包括脱蜡、复水、通透处理、蛋白酶消化或其他促进探针进入样本和暴露靶标的步骤。不同平台前处理要求不同。

4. 探针杂交

将特异性探针与目标 RNA / DNA 进行杂交。探针设计决定特异性和灵敏度，是原位杂交的关键。

5. 信号放大

不同平台采用不同放大策略。

6. 显色或荧光检测

通过显色体系或荧光成像显示杂交信号。不同路线可用于明场或荧光显微成像。

7. 显微成像

获取代表性视野图和整体分布图，用于分析空间表达模式和阳性细胞分布。

8. 数据分析

根据项目需求进行阳性信号计数、半定量评分、空间定位描述、多靶标共定位分析及图版整理。

原位杂交常见应用场景表

原位杂交与相关实验的应用区别

技术选择逻辑

• 研究 RNA/DNA      在细胞和组织中位于哪里：优先 原位杂交

• 研究 RNA 总体表达量是否变化：优先      qPCR

• 研究 蛋白在组织中的定位：优先 免疫组化

• 研究 蛋白在细胞内的精细定位：优先 免疫荧光

• 研究 某 RNA      结合蛋白绑定了哪些 RNA：优先 RIP

• 研究 转录因子是否结合某段 DNA：优先 ChIP

• 研究 某蛋白是否直接与 DNA motif 结合：优先 EMSA

南京博恩生物技术有限公司提供面向科研客户与医药企业的原位杂交实验外包服务，覆盖 RNA 空间表达分析、RNA FISH、组织切片 RNA-ISH、DNA FISH、融合转录本检测、剪接变体与短序列检测及发表级图版整理。项目交付包含原始染色/荧光图、代表性视野图、定位分析图、统计结果图及完整中文报告，并提供终身售后支持。
客户提交方案后，项目按“方案评估—问题反馈—报价签约—实验执行—PDF 结果确认—完整报告交付”的标准流程推进。交付结果可直接用于课题研究、论文整理、项目申报与结题汇报。